NCBI美国国立生物技术信息中心数据库

发布时间:2025-03-06 责任编辑:王永启  来源:技术服务部  点击数:

NCBI(美国国立生物技术信息中心)是在NIH的国立医学图书馆(NLM)的一个分支。它的使命包括四项任务:1. 建立关于分子生物学,生物化学,和遗传学知识的存储和分析的自动系统 ;2.实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处National Center for Biotechnology Information(美国国立生物技术信息中心,NCBI)是由美国国立卫生研究院(NIH)于1988年创办的国立医学图书馆(NLM)的一个分支。它的使命包括四项任务:1. 建立关于分子生物学,生物化学,和遗传学知识的存储和分析的自动系统 ;2.实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的,先进方法的研究;3. 加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用;4. 全世界范围内的生物技术信息收集的合作努力。NCBI数据库由Nucleotide(核苷酸序列数据库)、 Genome(基因组数据库)、Structure(结构数据库或称分子模型数据库) 、Taxonomy(生物学门类数据库)、 PopSet几个子库组成。 Nucleotide:该数据库由国际核苷酸序列数据库成员美国国立卫生研究院GenBank、日本DNA数据库(DDBJ)和英国Hinxton Hall的欧洲分子生物学实验室数据库(EMBL)三部分数据组成 。这三个组织联合组成国际核苷酸序列数据库协作体,每天交换各自数据库中的新增序列记录实现数据共享。其中的序列数据也通过与基因组序列数据库(GSDB)合作获取;专利序列数据通过与美国专利与商标局、国际专利局合作获取。 Genome:即基因组数据库,提供了多种基因组、完全染色体、Contiged序列图谱以及一体化基因物理图谱。 Structure:即结构数据库或称分子模型数据库(MMDB),包含来自X线晶体学和三维结构的实验数据。MMDB的数据从PDB(Protein Data Bank)获得。 Taxonomy:即生物学门类数据库,可以按生物学门类进行检索或浏览其核苷酸序列、蛋白质序列、结构等。 PopSet:包含研究一个人群、一个种系发生或描述人群变化的一组组联合序列。PopSet既包含核酸序列数据又包含蛋白质序列数据。 目前,NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能,而且都可以在NCBI的主页www.ncbi.nlm.nih.gov上找到相应链接,其中多半是由BLAST功能发展而来的。

 

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